Открытый код · pre-alpha

Считайте колонии
на чашке Петри
за секунды, а не часы.

Перетащите фото со смартфона. Petrilya найдёт каждую колонию, посчитает их и выгрузит готовый отчёт. Десктопное приложение с открытым кодом. Без программирования, без облака, без видеокарты.

AGPL-3.0 Без облака Без GPU На базе Cellpose

Чашка Петри с распознанными цветными колониями
200 колоний · 1,18 с
Процесс

Как это работает

Три клика от фото в телефоне до отчёта на столе у руководителя.

  1. 01

    Перетащите изображение

    JPG, PNG или TIFF — с микроскопа, телефона или сканера. Обработайте сразу целую папку в пакетном режиме.

  2. 02

    Нажмите «Анализ»

    Под капотом — Cellpose. Готовые модели находят все колонии без настройки параметров. Каждой присваивается ID, площадь, диаметр, эксцентриситет.

  3. 03

    Выгрузите отчёт

    PDF на одну страницу: превью, гистограмма, таблица. CSV для Excel. JSON-манифест с SHA-256 и параметрами запуска — для воспроизводимости в публикациях.

Возможности

Что умеет

Перетаскивание файлов

Сбросьте JPG, PNG или TIFF прямо из проводника. В пакетном режиме обрабатывает сразу всю папку с десятками чашек.

ИИ-сегментация

На базе библиотеки Cellpose. Предобученные модели находят колонии разной формы и размера без ручной настройки.

Ручная коррекция

Один клик удаляет ошибочно найденную колонию. Кисть добавляет пропущенную. Метрики пересчитываются мгновенно.

Зум и панорама

Колесо мыши — приближение в любую точку, Space + перетаскивание — сдвиг. F — вписать в окно. Удобно для деталей.

Реальные единицы

Укажите микрометры на пиксель — и площади выводятся в мкм², диаметры в мкм. Готово для раздела «Методы» в статье.

Отчёты для публикаций

PDF-отчёт с превью, гистограммой и таблицей. CSV для электронных таблиц. JSON-манифест с SHA-256 для воспроизводимости.

Работает на ноутбуке

Windows, macOS, Linux. CUDA — если есть, обычный CPU — если нет. Данные не покидают рабочую станцию.

Пакетная обработка

Указали папку — получили CSV, PDF и JSON для каждого изображения плюс сводный summary.csv. Можно идти пить чай.

Конфиденциально

Нет аналитики, нет аккаунтов, нет загрузки в облако. Чувствительные данные пациентов и фармы остаются у вас локально.

Начать

Скачать

Petrilya сейчас в стадии pre-alpha. Установщика пока нет — проект разрабатывается в открытую. Чтобы попробовать текущую сборку, склонируйте репозиторий.

git clone https://github.com/petrilya-app/petrilya-core.git
cd petrilya-core
python -m venv .venv
.\.venv\Scripts\Activate.ps1
pip install -e .
petrilya-ui

Релизы на GitHub Сообщить об ошибке

Для бизнеса

Для лабораторий и фармы

Petrilya распространяется по двойной лицензии: AGPL-3.0 для открытой сборки и коммерческая лицензия — для организаций, которым нужна локальная установка без обязательств copyleft. Это в том числе изолированные лабораторные сети и процессы под GMP.

Хотите пилот, интеграцию с вашей LIMS или собственные обучающие данные? Напишите: iliarogogvykh@gmail.com